La principal causa y la más común es la falta de ingesta de alimentos, lo que lleva a que el cuerpo gaste mas energías de la comida que consume, sin embargo, existen circunstancias ambientales, sociales y políticas que pueden incidir en la desnutrición de una persona, así como patologías médicas que produzcan la no absorción, o absorción deficiente de los nutrientes necesarios.
En el primer grupo podemos citar las hambrunas, guerras, conflictos armados, desplazamientos de poblaciones, sequías, plagas, así como, la más relevante de todas, la pobreza, como se puede observar específicamente en las países africanos, exceptuando África del Sur, y países en vías de desarrollo de América Latina.
Dentro del segundo encontramos la anorexia, la bulimia, celiaquia, depresión, problemas gastrointestinales. La desnutrición puede llegar a concluir en dos enfermedades: la primera es kwashiorkor, que es causada por la insuficiencia de proteínas en la dieta y la segunda marasmo, que genera una flaqueza exagerada a falta del consumo total de calorías en la dieta.
La desnutrición puede darse incluso en la gestación del feto lo que puede complicar el desarrollo normal del embarazo, y que puede llegar a causar que el bebe nazca con muy bajo peso, sea un niño enfermizo, muy propenso a infecciones, débiles y con problemas de desarrollo intelectual y de aprendizaje.
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